研究論文・学会発表

Research Papers

研究論文・学会発表

キチン分解酵素関連

不溶性多糖キチンを分解する細菌やキチン分解酵素に関する研究
学術論文(2001年以降)
 
H. Tanaka, H. Akutsu, I. Yabuta, M. Hara, H. Sugimoto, T. Ikegami, T. Watanabe, and T. Fujiwara. (2018) A novel chitin-binding mode of the chitin-binding domain of chitinase A1 from Bacillus circulans WL-12 revealed by solid-state NMR. FEBS Lett. 592(18): 3173-3182.
 
D. M. Tran, H. Sugimoto, D. A. Nguyen, T. Watanabe, and K. Suzuki. (2018) Identification and characterization of chitinolytic bacteria isolated from a freshwater lake. Biosci. Biotechnol. Biochem. 82(2):343-355.
 
A. Nakamura, T. Tasaki, Y. Okuni, C. Song, K. Murata, T. Kozai, M. Hara, H. Sugimoto, K. Suzuki, T. Watanabe, T. Uchihashi, H. Noji, and R. Iino. (2018) Rate constants, processivity, and productive binding ratio of chitinase A revealed by single-molecule analysis. Phys. Chem. Chem. Phys. 20(5):3010-3018.
 
H. Sugimoto, K. Nakamura, Y. Nishino, Y. Idezawa, Y. Fujinuma, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2016) Differences in the roles of the two surface-exposed tyrosine residues, Y240 and Y481, of Serratia marcescens chitinase B during processive degradation of crystalline chitin. J. Gen. Appl. Microbiol. 61:255-261.
 
K. Suzuki, M. Shimizu, N. Sasaki, C. Ogawa, H. Minami, H. Sugimoto, and T. Watanabe (2016) Regulation of the chitin degradation and utilization system by the ChiX small RNA in Serratia marcescens 2170. Biosci. Biotechnol. Biochem. 80(2):376-385.
 
Md Muzahid E Rahman, Delwar M. Hossain, Kazuki Suzuki, Ayaka Shiiya, Kazushi Suzuki, Tapan Kumar Dey, Masanori Nonaka, Naoki Harada (2016) Suppressive effects of Bacillus spp. on mycelia, apothecia and sclerotia formation of Sclerotinia sclerotiorum and potential as biological control of white mold on mustard. Australasian Plant Pathology. 45(1):103-117.
 
鈴木一史、杉本華幸、工藤江利子、伊藤学、渡邉剛志 (2015) 細菌由来の糖質加水分解酵素ファミリー18キチナーゼにおけるサブファミリーCの解析.キチン・キトサン研究 . 21 (3):209-218.
 
桜井大地、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2015) Serratia marcescens 2170のCBP21欠損株の構築.キチン・キトサン研究. 21(2):46-51.
 
K. Igarashi, T. Uchihashi, T. Uchiyama, H. Sugimoto, M. Wada, K. Suzuki, S. Sakuda, T. Ando, T. Watanabe, and M. Samejima (2014) Two-way traffic of glycoside hydrolase family 18 processive chitinases on crystalline chitin. Nature Communications. 5, Article number: 3975.
 
S. Takano, H. Syouta, T. Miura, C. Ogawa, H. Sugimoto, K. Suzuki, and T. Watanabe (2014) Construction and basic characterization of deletion mutants of the genes involved in chitin utilization by Serratia marcescens 2170. Biosci. Biotechnol. Biochem. 78(3):524-532.
 
M. Hara, H. Sugimoto, M. Uemura, K. Akagi, K. Suzuki, T. Ikegami, and T. Watanabe (2013) Involvement of Gln679, in addition to Trp687, in chitin-binding activity of the chitin-binding domain of chitinase A1 from Bacillus circulans WL-12. J. Biochem. 154(2):185-193.
 
T. Toratani, K. Suzuki, M. Shimizu, H. Sugimoto, and T. Watanabe (2012) Regulation of Chitinase Production by the 5′-Untranslated Region of the ybfM in Serratia marcescens 2170. Biosci. Biotechnol. Biochem. 76(10):1920-1924.
 
K. Ishii, T. Adachi, K. Imamura, S. Takano, K. Usui, K. Suzuki, H. Hamamoto, T. Watanabe, and K. Sekimizu (2012) Serratia marcescens induces apoptotic cell death in host immune cells via a lipopolysaccharide- and flagella-dependent mechanism. J. Biol. Chem. 287(43):36582-36592.
 
J. Watanabe, H. Tanaka, Y. Mogi, T. Yamazaki, K. Suzuki, T. Watanabe, O. Yamada, and O. Akita (2011) Loss of Aspergillus oryzae amyR function indirectly affects hemicellulolytic and cellulolytic enzyme production. J. Biosci. Bioeng. 111(4):408-413.
 
J. Watanabe, K. Uehara, Y. Mogi, K. Suzuki, T. Watanabe, and T. Yamazaki (2010) Improved transformation of the halo-tolerant yeast Zygosaccharomyces rouxii by electroporation. Biosci. Biotechnol. Biochem. 74(5):1092-1094
 
Y. Kezuka, M. Kojima, R. Mizuno, K. Suzuki, T. Watanabe, and T. Nonaka (2010) Structure of full-length class I chitinase from rice revealed by X-ray crystallography and small-angle X-ray scattering. Proteins 78(10):2295-305.
 
T. Toratani, T. Shoji, T. Ikehara, K. Suzuki and T. Watanabe (2008) The importance of chitobiase and N-acetylglucosamine (GlcNAc) uptake in N,N’-diacetylchitobiose [(GlcNAc)2] utilization by Serratia marcescens 2170. Microbiology 154(5):1326-1332.
 
R. Mizuno, Y. Itoh, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, K. Suzuki, T. Nonaka, and T. Watanabe (2008) Purification and characterization of a rice class I chitinase, OsChia1b, production in Escherichia coli. Biosci. Biotechnol. Biochem. 72(3):893-895.
 
R. Mizuno, T. Fukamizo, S. Sugiyama, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, T. Nonaka, K. Suzuki and T. Watanabe (2008) Role of the Loop Structure of the Catalytic Domain in Rice Class I Chitinase. J. Biochem. 143(4):487-495.
 
K. Suzuki, N. Sugawara, M. Suzuki, T. Uchiyama, F. Katouno, N. Nikaidou, and T. Watanabe (2002) Chitinases A, B, and C1 from Serratia marcescens 2170: Enzymatic Properties and Synergism on Chitin Degradation. Biosci. Biotechnol. Biochem. 66(5):1075-1083.
 
K. Suzuki, T. Uchiyama, M. Suzuki, N. Nikaidou, M. Regue, and T. Watanabe. (2001) LysR-type transcriptional regulator ChiR is essential for production of all chitinases and a chitin-binding protein, CBP21 in Serratia marcescens 2170. Biosci. Biotechnol. Biochem. 65(2):338-347.
 

総 説
 
渡邉剛志、杉本華幸、鈴木一史 (2014) Serratia marcescensのキチン分解利用機構. キチン・キトサン研究 20 (1):4-15.
 
杉本華幸、五十嵐圭日子、内橋貴之、鈴木一史、渡邉剛志 (2014) キチナーゼによる結晶性キチンのプロセッシブ(連続的)な分解機構の解明. 応用糖質科学 4 (2):107-112.
 

著 書
 
渡邉剛志、鈴木一史(分担執筆) (2011) 食品酵素化学の最新技術と応用II —展開するフードプロテオミクス— 第7章 キチナーゼ.シーエムシー出版 p. 70-78.
 

Proceeding(2007年以降)
 
K. Suzuki, H. Sugimoto, and T. Watanabe. (2016)
Regulation of chitinase system by small RNA in Serratia marcescens. Proceeding of the 6th international symposium for the development of integrated pest management (IPM) in Asia and Africa 2016. 77-82.
 
D. M. Tran, H. Sugimoto, and T. Watanabe, and K. Suzuki. (2016)
Screening of chitinolytic bacteria by measuring chitinase activity and biofilm formation. Proceeding of the 6th international symposium for the development of integrated pest management (IPM) in Asia and Africa 2016. 83-87.
 
K. Suzuki, M. Shimizu, N. Sasaki, and T. Watanabe. (2012)
Regulation of chitinase system in Serratia marcescens. Proceedings of the 9th asia pacific chitin and chitosan symposium. 127-131.
 
M. Uemura, N. Yamada, K. Akagi, S. Yoshio, T. Ikegami, K. Suzuki, and T.Watanabe. (2009)
Role of three aromatic residues in the chitin binding domain Chi18aC from Streptomyces coelicolor A3(2). Proceedings The 11th International Conference on Chitin and Chitosan & The 8th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium (CD-ROM). PE-14 (10143).
 
S. Okada, S. Sugiyama, R. Mizuno, T. Fukamizo, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, T. Nonaka, K. Suzuki, and T.Watanabe. (2009)
Functional analysis of loop structures in the catalytic domain of rice class I chitinase. Proceedings The 11th International Conference on Chitin and Chitosan & The 8th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium (CD-ROM). PE-13 (10140).
 
S. Sugiyama, S. Okada, R. Mizuno, T. Fukamizo, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, T. Nonaka, K. Suzuki, and T.Watanabe. (2009)
Local structure feature of the catalytic domain of rice class I chitinase. Proceedings The 11th International Conference on Chitin and Chitosan & The 8th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium (CD-ROM). E-S1 (10141).
 
A. Muto, A. Ohara, K. Azuma, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2008)
The role of exposed tryptophan and tyrosine residues on the surface of chitinase B from Serratia marcescens 2170. Abstracts and Proceeding of MIE BIOFORUM 2008. Biotechnology of Lignocellulose Degradation, Biomass Utilizattion and Biorefinery. 167.
 
T. Watanabe, R. Mizuno, K. Suzuki, Y. Kezuka, T. Nonaka, and Y. Nishizawa. (2007)
Antifungal chitinases: structure, function and possible application to biocontrol. Proceeding of the 1st international meeting for development of IPM in Asia and Africa, 88-94.
 

主な国際学会発表(2007年以降)
 
Y. Oda, K. Suzuki and H. Sugimoto (2018)
Comparative kinetic analysis of two processive type chitinases from Serratia marcescens. JOINT SYMPOSIUM OF 8th INTERNATIONAL AGRICULTURE CONGRESS 2018 AND 6th INTERNATIONAL SYMPOSIUM FOR FOOD AND AGRICULTURE 2018. P50, 11/13-15, (11/14), Serdang, Selangor, Malaysia, Poster presentation
 
N. Munakata, K. Horii, T. Yamagisi, Y. Kojima, H. Sugimoto and K. Suzuki (2018)
Small RNA ChiX and two target mRNAs coordinately control chitin degradation and utilization system in Serratia marcescens. KAAB International Symposium 2018. P-20, 9/27, Niigata, Japan, Poster presentation
 
I. Pentekhina, D.M. Tran, T. Hattori, T. Watanabe, H. Sugimoto and K. Suzuki (2018)
Chitinase system of Serratia plymuthica isolated from Sakata, a sand dune lake, in Niigata. KAAB International Symposium 2018. P-19, 9/27, Niigata, Japan, Poster presentation
 
I. Pentekhina, D.M. Tran, T. Hattori, T. Watanabe, H. Sugimoto and K. Suzuki (2018)
Identification of chitinase genes in chitinolytic bacteria isolated from Sakata in Niigata, Japan. The 14th International Chitin and Chitosan Conference & 12th Asia‐Pacific Chitin and Chitosan Symposium. OE-07, 8/27-30 (8/29) Suita, Osaka, Japan, Oral presentation
 
N. Munakata, K. Horii, T. Yamagishi, Y. Kojima, T. Watanabe, H. Sugimoto and K. Suzuki (2018)
Coordinated regulation of chitinase system by small RNA in Serratia marcescens. The 14th International Chitin and Chitosan Conference & 12th Asia‐Pacific Chitin and Chitosan Symposium. PE-14, 8/27-30 (8/29) Suita, Osaka, Japan, Poster presentation
 
T. Yamagisi, K. Horii, N. Munakata, H. Minami, H. Sugimoto, T. Watanabe, and K. Suzuki. (2017)
Regulation of chitinase system by small RNA ChiX in Serratia marcescens. KAAB International Symposium 2017 Frontiers in Plant Science and Biotechnology. P-19. 9/25, 2017. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
K. Suzuki, H. Sugimoto, and T. Watanabe. (2017)
Regulation of chitin degradation and utilization system by small RNA in Serratia marcescens. International Symposium 2017 Bioactive, Agricultural and Pharmaceutical Applications. 1/10 at Tay Nguyen University, Buon Ma Thuot, Vietnam
 
D. M. Tran, H. Sugimoto, T. Watanabe, and K. Suzuki. (2016)
Analysis of chitinolytic bacteria from freshwater lake. KAAB International Symposium 2016 Frontiers in Plant Science and Biotechnology. P-13. 9/28, 2016. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
K. Suzuki, H. Sugimoto, and T. Watanabe. (2016)
Regulation of chitinase system by small RNA in Serratia marcescens. The 6th international symposium for the development of integrated pest management (IPM) in Asia and Africa. Presen. 15. 3/2, 2016. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
D. M. Tran, H. Sugimoto, and T. Watanabe, and K. Suzuki. (2016)
Screening of chitinolytic bacteria by measuring chitinase activity and biofilm formation. The 6th international symposium for the development of integrated pest management (IPM) in Asia and Africa. Poster 16. 3/2, 2016. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
K. Suzuki, H. Minami, C. Ogawa, N. Sasaki, M. Shimizu, S. Takano, H. Sugimoto, and T. Watanabe. (2015)
Chitin degradation and utilization system regulated by small RNA in Serratia marcescens. KAAB International Symposium 2015 Frontiers in Plant Science and Biotechnology. P 16. 9/29, 2015. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
K. Suzuki, H. Minami, C. Ogawa, N. Sasaki, M. Shimizu, S. Takano, H. Sugimoto, and T. Watanabe (2015)
Role of small RNA in chitin degradation and utilization system of Serratia marcescens. The 5th Asian Conference on Green Technology in Agriculture: Chances and Challenges for a Better Life. 7/19-22, 2015. at Holiday Garden Hotel and Resort, Chiang Mai, Thailand.
 
T. Watanabe, T. Miura, H. Minami, C. Ogawa, S. Honma, H. Sugimoto, and K. Suzuki. (2014)
Chitin degradation and utilization system of Serratia marcescens 2170. ---Role and regulation of the chiPQ - ctb operon--- MIE BIOFORUM 2014 -Lignocellulose Degradation and Biorefinery-, Shima, Mie, Japan. p.112, 11/18-21, 2014. P40.
 
T. Watanabe, H. Sugimoto, and K. Suzuki. (2013)
Chitin degradation and utilization system of Serratia marcescens 2170. 10th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium / 27th Japanese Chitin and Chitosan Symposium. 10/4-8, 2013. EI-01.
 
H. Sugimoto, K. Nakamura, Y. Nishino, A. Fujinuma, H. Watanabe, T. Uchihashi, T. Ando, K. Igarashi, M. Wada, M. Samejima, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2013)
Studies on mechanism of crystalline chitin hydrolysis by Serratia marcescens chitinase B using high-speed atomic force microscopy. 10th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium / 27th Japanese Chitin and Chitosan Symposium. 10/4-8, 2013. PE-15.
 
K. Suzuki, N. Sasaki, C. Ogawa, M. Shimizu, S. Takano, H. Sugimoto, and T. Watanabe. (2013)
Regulation of chitin degradation and utilization system by ChiX small RNA in Serratia marcescens. 10th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium / 27th Japanese Chitin and Chitosan Symposium. 10/4-8, 2013. PE-33.
 
K. Suzuki, M. Shimizu, C. Ogawa, N. Sasaki, S. Takano, H. Sugimoto, and T. Watanabe. (2013)
Coordinate regulation of the chitin degradation and utilization system by small RNA in Serratia marcescens. American Society for Microbiology 113th General Meeting. May 18-21, 2013 at Colorado Convention Center, Denver, Colorado. 194 (CD-ROM)
 
K. Suzuki, N. Sasaki, C. Ogawa, H. Sugimoto, and T. Watanabe. (2012)
Regulation of chitinase gene expression by small RNA in Serratia marcescens. International Workshop on Agricultural Biotechnology & Sustainable Development. 6/21 at Tay Nguyen University, Buon Ma Thuot, Vietnam
 
T. Watanabe, H. Sugimoto, and K. Suzuki. (2012)
Structure, function and possible application of GH families 18 and 19 chitinases. International Workshop on Agricultural Biotechnology & Sustainable Development. 6/21 at Tay Nguyen University, Buon Ma Thuot, Vietnam
 
H. Sugimoto, A. Fujinuma, R. Maruya, K. Nakamura, Y. Hashizume, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2012)
Mechanism of crystalline chitin hydrolysis by a unique enzyme, Serratia marcescens chitinase B. International Workshop on Agricultural Biotechnology & Sustainable Development. 6/21 at Tay Nguyen University, Buon Ma Thuot, Vietnam
 
K. Suzuki, M. Shimizu, N. Sasaki, and T. Watanabe. (2011)
Regulation of chitinase system in Serratia marcescens. The 9th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium. 8/3-6, 2011. CS-01.
 
M. Uemura, N. Yamada, K. Akagi, S. Yoshio, T. Ikegami, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2009)
Role of three aromatic residues in the chitin binding domain of Chi18aC from Streptomyces coelicolor A3(2). The 3rd International Symposium “Sustainability in Food Production, Agriculture and the Environment in Asia” 9/28-10/1, 2009. P-50.
 
S. Okada, S. Sugiyama, R. Mizuno, T. Fukamizo, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, T. Nonaka, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2009)
Functional analysis of loop structures in the catalytic domain of rice class I chitinase. The 3rd International Symposium “Sustainability in Food Production, Agriculture and the Environment in Asia” 9/28-10/1, 2009. P-51.
 
M. Uemura, N. Yamada, K. Akagi, S. Yoshio, T. Ikegami, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2009)
Role of three aromatic residues in the chitin binding domain Chi18aC from Streptomyces coelicolor A3(2). The 11th International Conference on Chitin and Chitosan & The 8th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium. 9/6-9, 2009. 144.
 
S. Okada, S. Sugiyama, R. Mizuno, T. Fukamizo, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, T. Nonaka, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2009)
Functional analysis of loop structures in the catalytic domain of rice class I chitinase. The 11th International Conference on Chitin and Chitosan & The 8th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium. 9/6-9, 2009. 143.
 
S. Sugiyama, S. Okada, R. Mizuno, T. Fukamizo, Y. Nishizawa, Y. Kezuka, T. Nonaka, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2009)
Local structure feature of the catalytic domain of rice class I chitinase. The 11th International Conference on Chitin and Chitosan & The 8th Asia-Pacific Chitin and Chitosan Symposium. 9/6-9, 2009. 39.
 
A. Muto, A. Ohara, K. Azuma, K. Suzuki, and T. Watanabe. (2008)
The role of exposed tryptophan and tyrosine residues on the surface of chitinase B from Serratia marcescens 2170. MIE BIOFORUM 2008. 9/1-5, 2008. 86(CD-ROM).
 
T. Watanabe, R. Mizuno, K. Suzuki, Y. Kezuka, T. Nonaka, and Y. Nishizawa. (2007)
Antifungal chitinases: structure, function and possible application to biocontrol. The 1st international meeting for development of IPM in Asia and Africa. 11/26-28, 2007
 

主な国内学会発表(2007年以降)
 
小嶋優常、宗像直輝、堀井恭子、山岸拓矢、熊木智耶、杉本華幸、鈴木一史 (2019)
細菌におけるsmall RNA ChiXによるmRNAの再標的化機構の解析. 第21回日本RNA学会年会 p-72, 7/17-19 (7/18) 東京都文京区 ポスター発表
 
I. Pentekhina, D.M. Tran, T. Hattori, T. Watanabe, H. Sugimoto and K. Suzuki (2019)
Cloning and sequencing analysis of chitinase and AA10 protein genes in chitinase system of Serratia plymuthica SWSY-3.47. 日本農芸化学会2019年度大会1D7a11, 3/24-27 (3/24) 東京都世田谷区 口頭発表
 
小田陽介、小出優衣、多田瑞季、鈴木一史、杉本華幸 (2019)
2種の連続分解型キチナーゼの比較解析. 第60回 新潟生化学懇話会 P-45, 6/24 新潟市 ポスター発表
 
多田瑞季、渡邉美咲、鈴木一史、杉本華幸 (2019)
Bacillus circulans由来連続分解型キチナーゼの−3サブサイトの解析. 第19回日本蛋白質科学会年会 2P-148, 6/24-26 (6/24) 神戸市 ポスター発表
 
宗像直輝、堀井恭子、山岸拓矢、小嶋優常、杉本華幸、鈴木一史 (2018)
小分子RNA ChiXによる2種の標的mRNAの翻訳制御. 第20回日本RNA学会年会 p-25, 7/9-11 (7/9) 大阪市住之江区 ポスター発表
 
多田瑞季、小田陽介、猪浦弾、鈴木一史、渡邉剛志、杉本華幸 (2018)
連続反応性をもつ3種のキチナーゼによる基質分解反応の速度論的解析. 第18回日本蛋白質科学会年会 3P-076, 6/26-28 (6/28) 新潟市 ポスター発表
 
山岸拓矢、堀井恭子、宗像直輝、南晴香、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2018)
小分子RNA ChiXを介した2種のmRNAの転写後調節. 日本農芸化学会2018年度大会 2A06p18, 3/15-16 (3/16) 名古屋市天白区 口頭発表
 
杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2017)
キチナーゼによる基質連続分解機構に関する研究. 第58回 新潟生化学懇話会 p-10 口頭発表
 
D. M. Tran, H. Sugimoto, T. Watanabe, and K. Suzuki. (2017)
Analysis of chitinolytic bacteria from a freshwater lake in Niigata. 第31回日本キチン・キトサン学会大会 23(2):114-115. 2B-02. 8/23-24 (8/24), 2016. 宜野湾市 口頭発表
 
堀井恭子、南晴香、山岸拓矢、宗像直輝、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2017)
細菌の小分子RNAによるキチン分解系とキチン分解産物取り込み系の制御機構. 第31回日本キチン・キトサン学会大会 23(2):158. 1P-31. 8/23-24, 2016. 宜野湾市 口頭発表
 
堀井恭子、宗像直輝、山岸拓矢、南晴香、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2017)
2種のターゲットmRNAによる小分子RNA ChiXの制御. 第19回日本RNA学会年会 p.196, 7/19-21, 2017. P-80. 富山市 ポスター発表
 
杉本華幸、猪浦弾、鈴木一史、渡邉剛志 (2016)
サブサイト-3に位置するトリプトファン残基がSerratia marcescensキチナーゼAの基質連続分解機構におよぼす影響. 第30回日本キチン・キトサン学会大会 22 (2):112-113. 8/18-19, 2016. 2C-03
 
鈴木一史、南晴香、山岸拓矢、小川知佐奈、佐々木直美、杉本華幸、渡邉剛志 (2016)
Serratia marcescensにおけるsmall RNA・ChiXによるキチナーゼ発現抑制とその解除. 第30回日本キチン・キトサン学会大会 22 (2):94-95. 8/18-19, 2016. 1A-03
 
D. M. Tran, H. Sugimoto, T. Watanabe, and K. Suzuki. (2016)
Screening of chitinolytic bacteria from Sakata, a sand dune lake, in Niigata. 第30回日本キチン・キトサン学会大会 22 (2):159. 8/18-19, 2016. P-30
 
桜井大地、 杉本華幸、 鈴木一史、渡邉剛志 (2016)
Serratia marcescens 2170の多糖モノオキシゲナーゼCBP21の生理機能の解明. 日本農芸化学会 2016 年度大会. 4D017, 3/27-30 (3/30), 2016.
 
鈴木一史、 南晴香、山岸拓矢、小川知佐奈、佐々木直美、 杉本華幸、 渡邉剛志 (2016)
小分子RNA・ChiXによるchiR発現抑制とその解除. 日本農芸化学会2016年度大会. 3F111, 3/27-30 (3/29), 2016.
 
杉本華幸、 出澤有太、猪浦弾、鈴木一史、渡邉剛志 (2016)
Serratia marcescensキチナーゼBの結晶性キチン分解機構の解明 -触媒クレフト入口の芳香族アミノ酸残基の役割について-. 日本農芸化学会2016年度大会. 3D013, 3/27-30 (3/29), 2016.
 
南晴香、 鈴木一史、 佐々木直美、 山岸拓矢、 杉本華幸、 渡邉剛志 (2016)
Small RNA ChiXによる2種の標的 mRNAの発現制御機構. 第10回日本ゲノム微生物学会年会.1St-18 (1P-46), 3/4-5 (3/4), 2016.
 
杉本華幸、小林豊、鈴木一史、池上貴久、渡邉剛志 (2015)
Streptomyces coelicolorキチナーゼ18aC由来キチン結合ドメインのリガンド結合メカニズムの解明. 第29回日本キチン・キトサン学会大会 21 (2):130-131. 8/20-21, 2015. 2A-04
 
鈴木一史、天木拓海、南晴香、茶原麻衣、宮﨑裕介、坂井航、大辻大貴、杉本華幸、渡邉剛志 (2015)
細菌におけるpoly-β-1,6-GlcNAc合成酵素及び分解酵素遺伝子の解析. 第29回日本キチン・キトサン学会大会 21 (2):114-115. 8/20-21, 2015. 1B-02
 
鈴木一史、南晴香、小川知佐奈、佐々木直美、杉本華幸、渡邉剛志 (2015)
Serratia marcescensにおける小分子 RNA ChiX を介したchiR及びchiPQ-ctbの発現制御. 第17回日本RNA学会年会 p.133, 7/15-17, 2015. P-15.
 
今井裕也、五十嵐瑞礎、三浦拓馬、桜井大地、 杉本華幸、 鈴木一史、渡邉剛志 (2015)
Serratia marcescens 2170のキチン分解利用機構の解明:ChiD, Ctbの発現系構築とCBP21欠損株の構築. 日本農芸化学会2015年度大会 . 4E32a14, 3/26-29 (3/29), 2015.
 
渡邉剛志、杉本華幸、鈴木一史 (2014)
細菌のキチナーゼとキチン分解利用機 . 第2 回キチンキトサンシンンポジウム 20(2):112-113. 8/7-8, 2014. S2-01
 
三浦拓馬、本間祥太、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2014)
Serratia marcescens 2170のキチン分解利用機構 -chiPQ-ctbオペロンの機能解析-. 第28回キチンキトサンシンンポジウム 20 (2):181. 8/7-8, 2014. P-18
 
鈴木一史、小川知佐奈、 南晴香、 杉本華幸、渡邉剛志 (2014)
Serratia marcescensにおけるキチン分解産物の取り込みとsmall RNAによるキチナーゼ発現制御. 第28回キチンキトサンシンンポジウム 20 (2):160-161. 8/7-8, 2014. 2B-03
 
鈴木一史、南晴香、小川知佐奈、佐々木直美、杉本華幸、渡邉剛志 (2014)
Small RNA ChiXが制御するSerratia marcescensキチン分解利用系の解析. 第16回日本RNA学会年会 p.195, 7/23-25, 2014. P-83.
 
鈴木一史、小川知佐奈、南晴香、杉本華幸、渡邉剛志 (2014)
Small RNA を介したSerratia marcescensキチン分解利用系制御へのNagC及びChbRの関与. 日本農芸化学会2014年度大会. 2D02p20, 3/27-30 (3/28), 2014.
 
三浦拓馬、今井裕也、小川知佐奈、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2014)
Serratia marcescens 2170のキチン分解利用機構 -chiPQ-ctbオペロンの機能-. 日本農芸化学会2014年度大会. 2D02p19, 3/27-30 (3/28), 2014.
 
高橋亮大、森山拓実、猪又義広、杉本華幸、中川裕子、鈴木一史、戸谷一英、渡邉剛志 (2014)
Serratia marcescens 2170由来CBP21のファミリー19キチナーゼによるキチン分解への効果. 日本農芸化学会2014年度大会. 2D02p16, 3/27-30 (3/28), 2014.
 
杉本華幸、中村啓太、西野裕史、 藤沼晶子、 橋詰義夫、丸屋良輔、五十嵐圭日子、鮫島正浩、渡辺大輝、内橋貴之、安藤敏夫、鈴木一史、渡邉剛志 (2013)
構造一体型キチナーゼSerratia marcescensキチナーゼBの結晶性キチン分解機構の解明とフレキシブル型キチナーゼとの比較解析. 日本農芸化学会2013年度大会. 4C16p06, 3/24-27 (3/27), 2013.
 
鈴木一史、小川知佐奈、佐々木直美、髙野慎也、清水麻里、杉本華幸、渡邉剛志 (2013)
転写調節因子ChiRを介したMicM sRNAによるSerratia marcescensキチナーゼ遺伝子群発現制御. 日本農芸化学会2013年度大会. 3C16p08, 3/24-27 (3/26), 2013.
 
鈴木一史、清水麻里、佐々木直美、小川知佐奈、 髙野慎也、杉本華幸、渡邉剛志 (2013)
Serratia marcescensキチナーゼ系制御におけるMicM sRNAの役割. 第86回日本細菌学会総会 3/18-20, 2013. PB-224.
 
杉本華幸、藤沼晶子、中村啓太、西野裕史、五十嵐圭日子、鮫島正浩、渡辺大輝、内橋貴之、安藤敏夫、鈴木一史、渡邉剛志 (2012)
高速原子間力顕微鏡観察を用いたSerratia marcescensキチナーゼBの結晶性キチン分解機構の解明. 第85回日本生化学会大会 12/14-16, 2012. 3P-306 (3T04-03).
 
鈴木一史、清水麻里、佐々木直美、小川知佐奈、杉本華幸、渡邉剛志 (2012)
MicM sRNAによるSerratia marcescensキチン分解利用系の制御. 第35回日本分子生物学会年会 12/11-14, 2012. 3P-0183, 3ST2-034.
 
本間祥太、三浦拓馬、髙野慎也、佐々木直美、小川知佐奈、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2012)
Serratia marcescensキチン分解利用関連遺伝子の破壊と機能解析. 日本農芸化学会関東支部2012年度大会. 10/27-28 (10/27), 2012. P-62. 講演要旨集 p.56.
 
杉本華幸、藤沼晶子、中村啓太、西野裕史、五十嵐圭日子、鮫島正浩、鈴木一史、渡邉剛志 (2012)
Serratia marcescensキチナーゼBの結晶性キチン分解機構の解明. 日本農芸化学会関東支部2012年度大会. 10/27-28 (10/27), 2012. P-48. 講演要旨集 p.49.
 
鈴木一史、小川知佐奈、佐々木直美、杉本華幸、渡邉剛志 (2012)
Serratia marcescensにおけるキチン分解産物の取り込みによるキチナーゼ発現制御. 日本農芸化学会関東支部2012年度大会. 10/27-28 (10/27), 2012. P-45. 講演要旨集 p.48.
 
鈴木一史、佐々木直美、小川知佐奈、杉本華幸、渡邉剛志 (2012)
small RNAによるSerratia marcescensキチン分解利用遺伝子群の発現制御. 日本農芸化学会関東支部2012年度大会. 10/27-28 (10/27), 2012. P-41. 講演要旨集 p.46.
 
高橋亮大、竹本由衣、大塚未来、中川裕子、戸谷一英、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2012)
異なるファミリーに属するキチナーゼによる各種キチン分解特性. 日本農芸化学会関東支部2012年度大会. 10/27-28 (10/27), 2012. P-40. 講演要旨集 p.12.
 
橋詰義夫、丸屋良輔、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2012)
モジュール型キチナーゼによる結晶性キチン分解機構. 日本農芸化学会関東支部2012年度大会. 10/27-28 (10/27), 2012. P-35. 講演要旨集 p.43.
 
鈴木一史、清水麻里、佐々木直美、渡邉剛志 (2012)
Serratia marcescensにおけるsmall RNAによるキチン分解利用系の制御. 第14回日本RNA学会年会 7/18-20, 2012. P-4.
 
藤沼晶子、丸屋良輔、杉本華幸、中村啓太、橋詰義夫、五十嵐圭日子、鮫島正浩、鈴木一史、渡邉剛志 (2012)
Serratia marcescensキチナーゼBの特徴と結晶性キチン分解. 第26回キチンキトサンシンンポジウム 18(2):148-149. 7/12-13, 2012.
 
鈴木一史、佐々木直美、小川知佐奈、髙野慎也、杉本華幸、渡邉剛志 (2012)
Serratia marcescensにおけるキチン分解産物の取り込みとsmall RNAによるキチナーゼ発現制御. 第26回キチンキトサンシンンポジウム 18(2):132-133. 7/12-13, 2012.
 
髙野慎也、佐々木直美、本間祥太、小川知佐奈、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2012)
Serratia marcescensキチン分解利用関連遺伝子の遺伝子破壊. 日本農芸化学会2012年度大会. 3C10a07, 3/22-26 (3/24), 2012.
 
工藤まどか、中川裕子、鈴木一史、渡邉剛志、戸谷一英 (2012)
Streptomyces griseus由来推定 キチン結合タンパクの異種発現と機能解析. 日本農芸化学会2012年度大会. 3C10a05, 3/22-26 (3/24), 2012.
 
鈴木一史、清水麻里、佐々木直美、渡邉剛志 (2011)
Small RNA によるSerratia marcescensのキチナーゼ遺伝子発現調節機構. 第25回キチンキトサンシンンポジウム 17(2):208-209. 8/30-31, 2011.
 
竹本由衣、大塚未来、中川裕子、戸谷一英、鈴木一史、渡邉剛志 (2011)
立体構造の異なるキチナーゼによる各種キチンの分解特性. 第25回キチンキトサンシンンポジウム 17(2):194-195. 8/30-31, 2011.
 
植村迪夫、大塚未来、丸屋良輔、奥村明子、池上貴久、苅田修一、毛塚雄一郎、野中孝昌、杉本華幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2011)
キチン結合ドメインの立体構造と結合特性の比較解析. 第25回キチンキトサンシンンポジウム 17(2):234. 8/30-31, 2011.
 
鈴木一史、清水麻里、佐々木直美、虎谷忠幸、渡邉剛志 (2011)
Serratia marcescensにおけるsmall RNAによるキチナーゼ発現の制御. 日本農芸化学会2011 年度大会. 3C11p15, 3/26-28, 2011.(震災のため中止、発表成立)
 
竹本由衣、大塚未来、中川裕子、戸谷一英、 鈴木一史、渡邉剛志 (2011)
各種キチナーゼによるメカノケミカル粉砕キチンの分解特性. 日本農芸化学会2011年度大会. 3C11p13, 3/26-28, 2011.(震災のため中止、発表成立)
 
植村迪夫、丸屋良輔、遠藤陽太、苅田修一、蟹江美佐、池上貴久、奥村明子、毛塚雄一郎、野中孝昌、鈴木一史、渡邉剛志 (2011)
キチン結合ドメインの結合特性の比較解析. 日本農芸化学会2011年度大会. 3C11p11, 3/26-28, 2011.(震災のため中止、発表成立)
 
石井建一、臼井公人、今村亮俊、浜本洋、鈴木一史、渡邉剛志、関水和久 (2010)
セラチア菌のO抗原によるカイコ血球細胞の細胞死誘導. 第33回日本分子生物学会年会, 第83回日本生化学会大会 合同大会. 12/7-10, 2010. 2P-0985.
 
川見寿子、臼井公人、鈴木一史、武藤亜紀子、関水和久、渡邉剛志 (2010)
Serratia marcescens 2170のCBP21欠損株の構築とその性質. 第24回キチンキトサンシンンポジウム 16(2):202. 7/13-14, 2010.
 
鈴木一史、清水麻里、髙野慎也、虎谷忠幸、渡邉剛志 (2010)
Small RNAによるSerratia marcescensキチナーゼシステムの制御. 第24回キチンキトサンシンンポジウム 16(2):170-171. 7/13-14, 2010.
 
渡邉剛志、武藤亜紀子、工藤江利子、鈴木一史、五十嵐圭日子、鮫島正浩 (2010)
Serratia marcescensキチナーゼによる結晶性キチン分解. 第24回キチンキトサンシンンポジウム 16(2):128-129. 7/13-14, 2010.
 
川見寿子、臼井公人、鈴木一史、武藤亜紀子、関水和久、渡邉剛志 (2010)
Serratia marcescens 2170のCBP21欠損株の構築と性質の解析. 日本農芸化学会2010年度大会. 3AFa11. 3/28-30, 2010.
 
植村迪夫、丸屋良輔、山田伸明、原政司、池上貴久、毛塚雄一郎、野中孝昌、鈴木一史、渡邉剛志 (2010)
細菌キチナーゼキチン結合ドメインの結合特性の比較解析. 日本農芸化学会2010年度大会. 3AFa10. 3/28-30, 2010.
 
奥村明子、近石絵理子、高井朋代、吉尾幸子、森田潤司、植村迪夫、鈴木一史、渡邉剛志、池上貴久 (2009)
土壌放線菌由来キチン分解酵素Chi18aCの基質吸着ドメインのNMRによる立体構造の解析. 第 82回日本生化学会大会. 2P-230. 10/21-24, 2009.
 
杉山真一、岡田真司、深溝慶、毛塚雄一郎、野中孝昌、鈴木一史、渡邉剛志 (2009)
ファミリー19キチナーゼ活性ドメインの局所構造と分解生成物. 第23回キチンキトサンシンンポジウム 15(2):160-161. 8/20-21, 2009.
 
木村貴一、大野剛、木村(新野)葉子、高橋慶太郎、鈴木一史、渡邉剛志 (2009)
Lactobacillus sakei KLB 3138aC株の特性と清酒醸造への応用. 日本農芸化学会2009年度大会. 2P0695A. 3/28-29, 2009
 
吉田優、川見寿子、菅丈司、水野亮二、毛塚雄一郎、野中孝昌、池上貴久、鈴木一史、渡邉剛志 (2009)
Streptomyces griseus HUT6037由来キチナーゼCの構造と機能の解明. 日本農芸化学会2009年度大会. 2P0371A. 3/28-29, 2009
 
杉山真一、水野亮二、岡田真司、西澤洋子、深溝慶、毛塚雄一郎、野中孝昌、鈴木一史、渡邉剛志 (2009)
イネクラスIキチナーゼ活性ドメインにおけるループ構造の機能解析. 日本農芸化学会2009年度大会. 2P0339A. 3/28-29, 2009
 
杉山真一、水野亮二、西澤洋子、深溝慶、毛塚雄一郎、野中孝昌、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
イネクラスIキチナーゼ活性ドメインのループIIの機能解析. 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会. 3P-0047. 12/9-12, 2008.
 
吉田優、水野亮二、菅丈司、毛塚雄一郎、野中孝昌、池上貴久、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
Streptomyces griseus HUT6037由来キチナーゼCの構造と機能の解明. 第22回キチンキトサンシンンポジウム 14(2):238. 8/5-6, 2008.
 
虎谷忠幸、山内友恵、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
Serratia marcescensのキチナーゼ発現におけるybfM 5’-UTRの重要性. 第22回キチンキトサンシンンポジウム 14(2):237. 8/5-6, 2008.
 
武藤亜紀子、大原麻子、吾妻香織、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
Serratia marcescens 2170由来キチナーゼBの表面に露出したトリプトファン及びチロシン残基の機能. 第22回キチンキトサンシンンポジウム 14 (2):236. 8/5-6, 2008.
 
吉田優、菅丈司、水野亮二、毛塚雄一郎、野中孝昌、池上貴久、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
Streptomyces griseus HUT6037由来キチナーゼCの構造と機能の解明. 日本農芸化学会2008年度大会. 34. 3/27-29, 2008.
 
虎谷忠幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
Serratia marcescensのキチナーゼ発現におけるybfM 5’-UTRの重要性. 日本農芸化学会2008年度大会. 34. 3/27-29, 2008.
 
武藤亜紀子、大原麻子、吾妻香織、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
Serratia marcescens 2170由来キチナーゼBの表面に露出したトリプトファン及びチロシン残基の機能. 日本農芸化学会2008年度大会. 34. 3/27-29, 2008.
 
庄司俊裕、虎谷忠幸、宮本勝城、辻坊裕、鈴木一史、渡邉剛志 (2008)
転写因子chiRを破壊したSerratia marcescensのプロテオーム解析. 日本農芸化学会2008年度大会. 33. 3/27-29, 2008.
 
菅丈司、山田伸明、水野亮二、野中孝昌、毛塚雄一郎、池上貴久、鈴木一史、渡邉剛志 (2007)
Streptomyces griseus HUT6037 キチナーゼCのキチン吸着機構. 日本農芸化学会2007年度大会. 62. 3/25-27, 2007.
 
虎谷忠幸、鈴木一史、渡邉剛志 (2007)
Serratia marcescens 2170 の発現に関与する外膜蛋白質. 日本農芸化学会2007年度大会. 63. 3/25-27, 2007.
 
水野亮二、大橋大輔、鈴木一史、渡邉剛志 (2007)
Vibrio fisheri MKT20由来ファミリー19キチナーゼの機能解析. 第21回キチンキトサンシンンポジウム 13(2):210. 7/26-27, 2007.
 
虎谷忠幸、庄司俊裕、鈴木一史、渡邉剛志 (2007)
Serratia marcescens 2170のキチン分解利用に関わるオペロンの機能解析. 第21回キチンキトサンシンンポジウム 13 (2):160-161. 7/26-27, 2007.
 
 
 
 
 

遺伝子発現調節関連

主にsmall RNAが関与する遺伝子発現調節機構に関する研究
学術論文(2001年以降)
 
C. A. Vakulskas, Y. Leng, H. Abe, T. Amaki, A. Okayama, P. Babitzke, K. Suzuki, and T. Romeo. (2016) Antagonistic control of the turnover pathway for the global regulatory sRNA CsrB by the CsrA and CsrD proteins. Nucl. Acids Res. 44(16): 7896-7910.

Ito, M., K. Nomura, H. Sugimoto, T. Watanabe, and K. Suzuki. (2014) Identification of a Csr system in Serratia marcescens 2170. J. Gen. Appl. Microbiol. 60:79-88.
 
Suzuki, K., P. Babitzke, S. R. Kushner, and T. Romeo. (2006) Identification of a novel regulatory protein (CsrD) that targets the global regulatory RNAs CsrB and CsrC for degradation by RNase E. Genes & Development 20:2605-2617.
 
Mercante, J., K. Suzuki, X. Cheng, P. Babitzke, and T. Romeo. (2006) Comprehensive alanine-scanning mutagenesis of Escherichia coli CsrA defines two subdomains of critical functional importance. J. Biol. Chem. 281:31832-31842.
 
Mondragón, V., B. Franco, K. Jonas, K. Suzuki, T. Romeo, Ö. Melefors, and D. Georgellis. (2006) pH dependent activation of the BarA-UvrY two-component system in Escherichia coli. J. Bacteriol. 188: 8303-8306.
 
Wang, X., A. K. Dubey, K. Suzuki, C. S. Baker, P. Babitzke, and T. Romeo. (2005) CsrA post-transcriptionally represses pgaABCD, responsible for synthesis of a biofilm polysaccharide adhesin of Escherichia coli. Mol. Microbiol. 56:1648-1663.
 
Dubey, A. K., C. S. Baker, K. Suzuki, A. D. Jones, P. Pandit, T. Romeo, and P. Babitzke. (2003) CsrA regulates translation of the Escherichia coli carbon starvation gene, cstA, by blocking ribosome access to the cstA transcript. J. Bacteriol. 185:4450-4460.
 
Weilbacher, T., K. Suzuki, A. K. Dubey, X. Wang, S. Gudapaty, I. Morozov, C. S. Baker, D. Georgellis, P. Babitzke, and T. Romeo. (2003) A novel sRNA member of the carbon storage regulatory system of Escherichia coli. Mol. Microbiol. 48:657-670.
 
Pernestig, A. -K., D. Georgellis, T. Romeo, K. Suzuki, H. Tomenius, S. Normark, and Ö. Melefors. (2003) The Escherichia coli BarA-UvrY two-component system is needed for efficient switching between glycolytic and gluconeogenic carbon sources. J. Bacteriol. 185:843-853.
 
Suzuki, K., X. Wang, T. Weilbacher, A. -K. Pernestig, Ö. Melefors, D. Georgellis, P. Babitzke, and T. Romeo. (2002) Regulatory circuitry of the CsrA/CsrB and BarA/UvrY systems of Escherichia coli. J. Bacteriol. 184:5130-5140.
 
Baker, C. S., I. Morozov, K. Suzuki, T. Romeo, and P. Babitzke. (2002) CsrA regulates glycogen biosynthesis by preventing translation of glgC in Escherichia coli. Mol. Microbiol. 44:1599-1610.
 
Suzuki, K., N. Sugawara, M. Suzuki, T. Uchiyama, F. Katouno, N. Nikaidou, and T. Watanabe. (2002) Chitinases A, B, and C1 from Serratia marcescens 2170 produced by recombinant Escherichia coli: enzymatic properties and synergism on chitin degradation. Biosci. Biotechnol. Biochem. 66:1075-1083.
 
Jackson, D. W., K. Suzuki, L. Oakford, J. W. Simecka, M. E. Hart, and T Romeo. (2002) Biofilm formation and dispersal under the influence of the global regulator CsrA of Escherichia coli. J. Bacteriol. 184:290-301.
 
Gudapaty, S., K. Suzuki, X. Wang, P. L. Babitzke and T. Romeo. (2001) Regulatory interactions of Csr components: the RNA binding protein CsrA activates csrB transcription in Escherichia coli. J. Bacteriol. 183:6017-6027.
 

総説・著書
 
鈴木一史 (2007) Small RNA (CsrB/C) の分解を制御するGGDEF-EAL タンパク質CsrD. 実験医学 25:397-401.
 
Suzuki, K. (2007) Post-transcriptional regulation by the Csr global regulatory system in Escherichia coli. Bull. Facul. Agric. Niigata Univ. 59:56-63.
 

国際学会発表
 
N. Ishiguro, S. Yamada, W. Sakai, H. Sugimoto, and K. Suzuki. (2018)
Production of poly-β-1,6-GlcNAc using Csr system in Escherichia coli. KAAB International Symposium 2018 Frontiers in Plant Science and Biotechnology. P-18. 9/27, 2018. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
S. Yamada, H. Sugimoto and K. Suzuki (2018)
Effect of CsrD and PTS sugar addition on half-life of small RNA CsrB in Escherichia coli. JOINT SYMPOSIUM OF 8th INTERNATIONAL AGRICULTURE CONGRESS 2018 AND 6th INTERNATIONAL SYMPOSIUM FOR FOOD AND AGRICULTURE 2018. P57, 11/13-15, (11/14), Serdang, Selangor, Malaysia, Poster presentation
 
Y. Hosoi, R. Saito, I. Kimura, T. Konno, Y. Kusama, D. Watanabe, T. Kuge, K. Tsukada, H. Sugimoto, T. Watanabe, and K. Suzuki. (2017)
Functional analysis of GGDEF/EAL domain proteins, YliE/YliF in Escherichia coli. KAAB International Symposium 2017 Frontiers in Plant Science and Biotechnology. P-16. 9/25, 2017. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
S. Yamada, T. Amaki, H. Sugimoto, and K. Suzuki. (2017)
Decay control of small RNA in Csr system of Escherichia coli. KAAB International Symposium 2017 Frontiers in Plant Science and Biotechnology. P-15. 9/25, 2017. at Niigata University, Niigata, Japan.
 
K. Suzuki, M. Ito, A. Okayama, T. Watanabe, and T. Romeo. (2010)
Analysis of turnover of the global regulatory RNA CsrB in Escherichia coli.
American Society for Microbiology 110th General Meeting. May 23-27, 2010 at San Diego Convention Center, San Diego, California. H-2150 (CD-ROM)
 
K. Suzuki, Y. Fujiu, T. Mizuno, T. Watanabe, and T. Romeo. (2008)
Site-Directed Mutagenesis of CsrD, a Specificity Factor for Degradosome-Mediated Decay of CsrB/C RNAs in Escherichia coli.
American Society for Microbiology 108th General Meeting. Jun 1-5, 2008 at Boston Convention & Exhibition Center, Boston, Massachusetts. H148 (CD-ROM)
 
C. C. Goller, A. Pannuri, Y. Itoh, K. Suzuki, and T. Romeo. (2008)
PGA Accumulation and Biofilm Formation in Escherichia coli: Modulation by c-di-GMP.
American Society for Microbiology 108th General Meeting. Jun 1-5, 2008 at Boston Convention & Exhibition Center, Boston, Massachusetts. H057 (CD-ROM)
 
K. Suzuki, P. Babitzke, and T. Romeo. (2006)
Evidence that the GGDEF/EAL Protein CsrD Functions Independently of Cyclic-di-GMP in Escherichia coli.
American Society for Microbiology 106th General Meeting. May 21-25, 2006 at Orange County Convention Center, Orlando, Florida.
 
J. Mercante, K. Suzuki, P. Babitzke, and T. Romeo. (2006)
Comprehensive Alanine-Scanning Mutagenesis of CsrA, an RNA-Binding Global Regulatory Protein of Escherichia coli, Reveals Two Adjacent, Anti-Parallel Beta Strands of Critical Functional Importance.
American Society for Microbiology 106th General Meeting. May 21-25, 2006 at Orange County Convention Center, Orlando, Florida.
 
K. Suzuki, P. Babitzke, S. R. Kushner, and T. Romeo. (2005)
The GGDEF/EAL Protein, CsrD, Regulates the Stability of the Small Noncoding RNAs CsrB and CsrC in Escherichia coli.
American Society for Microbiology 105th General Meeting. June 5-9, 2005 at Georgia World Congress Center, Atlanta, Georgia.
 
J. Mercante, K. Suzuki, P. Babitzke, and T. Romeo. (2005)
Comprehensive Alanine-Scanning Mutagenesis of CsrA, an RNA-Binding Global Regulatory Protein of Escherichia coli.
American Society for Microbiology 105th General Meeting. June 5-9, 2005 at Georgia World Congress Center, Atlanta, Georgia.
 
X. Wang, A. K. Dubey, K. Suzuki, C. S. Baker, P. Babitzke, and T. Romeo. (2005)
Mechanism of Escherichia coli Biofilm Regulation by the Csr Signaling Circuitry.
American Society for Microbiology 105th General Meeting. June 5-9, 2005 at Georgia World Congress Center, Atlanta, Georgia.
 
K. Suzuki, P. Babitzke, and T. Romeo. (2004)
YhdA Regulates the Synthesis of the Small Noncoding RNAs CsrB and CsrC in Escherichia coli.
American Society for Microbiology 104th General Meeting. May 23-27, 2004 at Ernest N. Morial Convention Center, New Orleans, Louisiana.
 
C. S. Baker, A. Dubey, K. Suzuki, T. Romeo, and P. Babitzke. (2003)
CsrA regulates transcription of Escherichia coli carbon starvation gene, cstA, by blocking ribosome access to the cstA ribosome binding site.
American Society for Microbiology 103rd General Meeting. May 18-22, 2003 at Washington Convention Center, Washington, DC.
 
K. Suzuki, A. Pernestig, Ö. Melefors, D. Georgellis, P. Babitzke, and T. Romeo. (2002)
Regulation of csrB transcription via sdiA and the BarA/UvrY two-component system of Escherichia coli.
American Society for Microbiology 102nd General Meeting. May 19-23, 2002 at Salt Palace Convention Center, Salt Lake City, Utah.
 
A. Pernestig, D. Georgellis, K. Suzuki, T. Romeo, S. Normark, and Ö. Melefors. (2002)
Do hungry bacteria communicate via the BarA-UvrY two-component system?
American Society for Microbiology 102nd General Meeting. May 19-23, 2002 at Salt Palace Convention Center, Salt Lake City, Utah.
 
C. S. Baker, I. Morozov, K. Suzuki, T. Romeo, and P. Babitzke. (2001)
CsrA binding to the E. coli glgC transcript regulates glycogen biosynthesis by inhibiting binding.
Molecular Genetics of Bacteria and Phages. July 31-Aug 5, 2001 at the University of Wisconsin-Madison.
 
K. Suzuki, S. Gudapaty, P. L. Babitzke, and T. Romeo. (2001)
The global regulatory protein CsrA indirectly regulates csrB transcription.
American Society for Microbiology 101st General Meeting. May 20-24, 2001 at Orange County Convention Center, Orlando, Florida.
 

国内学会発表
 
石黒志実、山田竣太、坂井航、井上智恵、杉本華幸、鈴木一史 (2019)
大腸菌におけるsmall RNA CsrB安定性制御とCsrシステムを利用したpoly-β-1,6-GlcNAc産生. 第21回日本RNA学会年会P-71, 7/17-19 (7/17) 東京都文京区 ポスター発表
 
山田竣太、石黒志実、坂井航、杉本華幸、鈴木一史 (2019)
大腸菌におけるCsrDによるsmall RNA CsrBの分解制御とCsrシステムの利用. 日本農芸化学会2019年度大会 3C4p11, 3/24-27 (3/26) 東京都世田谷区 口頭発表
 
N. Ishiguro, S. Yamada, W. Sakai, H. Sugimoto and K. Suzuki (2018)
Regulation of small RNA degradation by CsrD and production of poly-β-1,6-GlcNAc by control of Csr system in Escherichia coli. 第41回日本分子生物学会年会 1LBA-026, 11/28-30 (11/28) 横浜市西区 ポスター発表
 
鈴木一史 (2018)
Small RNAの安定性が関与する細菌の遺伝子発現制御機構. 生化学若い研究者の会・北陸支部主催 夏の研究セミナー 招待講演 7/21 長岡市 口頭発表
 
山田竣太、天木拓海、杉本華幸、鈴木一史 (2018)
大腸菌における小分子RNA CsrBの半減期にあたえるCsrDと炭素源の濃度による影響. 第20回日本RNA学会年会 P-26, 7/9-11 (7/10) 大阪市住之江区 ポスター発表
 
K. Suzuki, S. Yamada, T. Amaki and H. Sugimoto (2018)
Stability change of small RNA CsrB in response to glucose in Escherichia coli. 第91回日本細菌学会総会 P-188 ポスター発表
 
天木拓海、坂井航、山田竣太、飯田和奏、渡邉剛志、杉本華幸、鈴木一史 (2017)
大腸菌Csrシステムにおける小分子RNA CsrBの分解制御. 環境微生物系学会合同大会2017. P-081. 8/29-31 (8/30), 2017 仙台市 ポスター発表
 
天木拓海、山田竣太、杉本華幸、鈴木一史 (2017)
大腸菌における小分子RNA CsrBの半減期にあたえるCsrDと炭素源の影響. 第19回日本RNA学会年会 p.199, 7/19-21, 2017. P-83. 富山市 ポスター発表
 
天木拓海、坂井航、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2017)
大腸菌CsrDによる小分子RNA CsrBの分解制御. 日本農芸化学会2017年度大会. 2C24p07, 3/17-20 (3/18), 2017. 京都市 口頭発表
 
鈴木一史 、天木拓海 、坂井航 、杉本華幸、渡邉剛志 (2017)
大腸菌における小分子RNA CsrBの分解制御機構. 第11回日本ゲノム微生物学会年会. 2O1-02, 3/2-4 (3/3), 2017. 藤沢市 口頭発表
 
阿部葉月、天木拓海、伊藤 学、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2015)
大腸菌 CsrシステムにおけるCsrB RNAの分解過程の解析. 第9回日本ゲノム微生物学会年会. 3/6-8, 2015. 1P-58, 1St1-22.
 
草間慶弘、渡部大樹、今野環、久下貴紀、塚田海斗、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2015)
大腸菌におけるGGDEF/EALドメインタンパク質YliE/YliFの機能解析. 日本農芸化学会2015年度大会. 3B41a08, 3/26-29 (3/28), 2015.
 
伊藤学、岡山明裕、阿部葉月、高橋優介、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2014)
大腸菌におけるCsrB RNAの分解過程の解析. 日本農芸化学会2014年度大会. 3/27-30 (3/28), 2014. 2A11p19.
 
伊藤学、岡山明裕、高橋優介、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2013)
大腸菌におけるCsrB RNA分解産物の解析. 第36回日本分子生物学会年会. 12/3-6, 2013. P1-0004.
 
伊藤学、野村和希、高橋優介、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2013)
Serratia marcescensのCsrシステム及びCsrB/C RNAの安定性を制御するCsrDの機能解析. 日本農芸化学会2013年度大会. 3/24-27 (3/25), 2013. 2B14a13.
 
伊藤学、野村和希、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2012)
Serratia marcescens CsrDによるsmall RNAの安定性制御. 日本農芸化学会関東支部2012年度大会. 10/27-28 (10/27), 2012. O-02. 講演要旨集 p.12
 
高橋優介、岡山明裕、伊藤学、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2012)
大腸菌におけるGGDEF-EALドメインタンパク質CsrDによるsmall RNA半減期の調節. 日本農芸化学会2012 年度大会. 3/22-26 (3/24), 2012. 3C21p10.
 
塚田海斗、渡部大樹、杉本華幸、渡邉剛志、鈴木一史 (2012)
大腸菌におけるGGDEF-EALドメインタンパク質の機能解析. 日本農芸化学会2012年度大会. 3/22-26 (3/24), 2012. 3C21p09.
 
鈴木一史、岡山明裕、伊藤学、渡邉剛志、Tony Romeo (2010)
 
Analysis of degradation intermediates of CsrB RNA in Escherichia coli. 第12回日本RNA学会年会. 7/27-29, 2010. P-28.
 
鈴木一史、伊藤学、岡山明裕、水野孝彦、渡邉剛志、Tony Romeo (2010)
大腸菌CsrB RNAの分解機構. 日本農芸化学会2010年度大会. 3/28-30, 2010. 3ASp19.
 
K. Suzuki, M. Ito, T. Watanabe, and Tony Romeo (2009)
Analysis of CsrB small RNA decay in Escherichia coli. 第32回日本分子生物学会年会. 12/9-12, 2009. 4P-0312.
 
水野孝彦、Tony Romeo、渡邉剛志、鈴木一史 (2008)
大腸菌CsrB/C RNAの安定性を制御するCsrDの解析. 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会 合同大会. 12/9-12, 2008. 1P-0915.
 
藤生康宏、水野孝彦、Tony Romeo、渡邉剛志、鈴木一史 (2008)
大腸菌small RNA CsrB/Cの安定性を制御するCsrDのアラニン置換変異による解析. 日本農芸化学会2008年度大会. 3/27-29, 2008. 254.
 
 
 
 
 

タンパク質・酵素機能関連

タンパク質・酵素の機能や安定性に関する研究
学術論文(2003年以降)
 
Masuda, Y., Miyake, H., Tanaka, A., and Sugimoto, H. (2017) Calorimetric study on the binding of β-cyclodextrin to the starch-binding domain of Aspergillus niger glucoamylase. Netsu Sokutei, 44(4):135-138.
 
Sugimoto, H., Noda, Y., and Segawa, S. (2011) NMR analysis of a kinetically trapped intermediate of a disulfide-deficient mutant of the starch-binding domain of glucoamylase. J. Mol. Biol. 412:304-315.
 
Sugimoto, H., Nakaura, M., Nishimura, S., Karita, S., Miyake, H., and Tanaka, A. (2009) Kinetically trapped metastable intermediate of a disulfide-deficient mutant of the starch-binding domain of glucoamylase. Protein Sci., 18:1715-1723.
 
Uchiyama, R., Aoki, K., Sugimoto, H., Taka, N., Katayama, T., Itonori, S., Sugita, M., Che, F., Kumagai, H., and Yamamoto, K. (2009) Phosphocholine-containing glycosyl inositol-phosphoceremides from Trichoderma viride induce defense responses in cultured rice cells. Biosci. Biotechnol. Biochem., 73:74-80.
 
Suzuki, R., Wada, J., Katayama, T., Fushinobu, S., Wakagi, T., Shoun, H., Sugimoto, H., Tanaka, A., Kumagai, H., Ashida, H., Kitaoka, M., and Yamamoto, K. (2008) Structural and thermodynamic analyses of solute-binding protein from Bifidobacterium longum specific for core 1 disaccharide and lacto-N-biose. J. Biol. Chem., 283:13165-13173.
 
Sugimoto, H., Nishiya, Y., Miyake, H., and Tanaka, A. (2008) Stabilization mechanism of chloride ion on thermal denaturation of Arthrobacter sarcosine oxidase. Netsu Sokutei, 35:76-80.
 
Sugimoto, H., Nakaura, M., Kosuge, Y., Imai, K., Miyake, H., Karita, S., and Tanaka, A. (2007) Thermodynamic effects of disulfide bond on thermal unfolding of the starch-binding domain of Aspergillus niger glucoamylase. Biosci. Biotechnol. Biochem., 71:1535-1541.
 
Tanaka, A., Sugimoto, H., Muta, Y., Mizuno, T., Senoo, K., Obata, H., and Inouye, K. (2003) Differential scanning calorimetry of the effects of Ca2+ on the thermal unfolding of Pseudomonas cepacia lipase. Biosci. Biotechnol. Biochem., 67:207-210
 
 
国際学会発表
 
R. Nakamura, K. Suzuki and H. Sugimoto (2018)
Effects of disulfide bonds on the stability of a lytic polysaccharide monooxygernase, CBP 21. JOINT SYMPOSIUM OF 8th INTERNATIONAL AGRICULTURE CONGRESS 2018 AND 6th INTERNATIONAL SYMPOSIUM FOR FOOD AND AGRICULTURE 2018. P51, 11/13-15, (11/14), Serdang, Selangor, Malaysia, Poster presentation
 

国内学会発表
 
中村禄朗、中島優一、渡邉剛志、鈴木一史、杉本華幸 (2019)
ジスルフィド結合がキチン分解モノオキシゲナーゼCBP21の構造安定性に及ぼす影響について. 第19回日本蛋白質科学会年会 1P-127, 6/24-26 (6/25) 神戸市 ポスター発表
 
杉本華幸、中島優一、中村禄朗、渡邉剛志、鈴木一史 (2019)
多糖モノオキシゲナーゼ,CBP21の構造安定性 ―金属イオンの効果―. 日本農芸化学会2019年度大会 3E5p02, 3/24-27 (3/26) 東京都世田谷区 口頭発表
 
杉本華幸、本山彩香、片桐絵里奈、渡邉剛志、鈴木一史 (2018)
Effects of metal ions on the thermal unfolding of lytic polysaccharide monooxygenase, CBP21. 第56回生物物理学会年会 2Pos025, 9/15-17 (9/17) 岡山市 ポスター発表
 
杉本華幸 (2018)
微生物由来キチン分解モノオキシゲナーゼの構造安定性. 日本農芸化学会中部支部第182回例会 p11-12 招待講演, 6/9 津市 口頭発表
 
杉本華幸、本山彩香、片桐絵里奈、渡邉剛志、鈴木一史 (2018)
多糖モノオキシゲナーゼ,CBP21の構造安定性. 日本農芸化学会2018年度大会 2A21a08 , 3/15-16 (3/16) 名古屋市天白区口頭発表
 
杉本華幸、片桐絵里奈、田中晶善、渡邉剛志、鈴木一史 (2017)
キチン結合タンパク質(CBP21)の構造安定性に対する銅イオンの効果. 第55回生物物理学会年会. 2Pos045, 9/19-21 (9/20), 2017. ポスター発表、熊本
 
H. Sugimoto (2014)
Analysis of an unusually stable kinetic refolding intermediate. 第52回日本生物物理学会年会 p.54 supplement1-1 s53
 
 
 
 
 

その他・発酵関連

その他・発酵関連に関する研究
国際学会発表
 
S. Suzuki, S. Takeuchi, M. Suzuki and K. Suzuki (2018)
Effective sake promotion in the world and breeding wild yeast to obtain new customers. JOINT SYMPOSIUM OF 8th INTERNATIONAL AGRICULTURE CONGRESS 2018 AND 6th INTERNATIONAL SYMPOSIUM FOR FOOD AND AGRICULTURE 2018. P52, 11/13-15, (11/14), Serdang, Selangor, Malaysia, Poster presentation